Флаг создан с учётом герба городского поселения Клин, который разработан на основе исторического герба уездного города Клина Московской губернии высочайше утверждённого 16 марта 1883 года

Официальный герб Клин получил 20 декабря 1781 года. С тех пор он несколько раз видоизменялся, но главным в нем оставалось одно: герб города Клин украшает почтальон, скачущий на черном коне с золотым рожком в руках.